Het lot van „Stokrotka", een jong meisje dat na verloop van tijd een ervaren koerierster van de AK wordt, raakt verweven met het drama van het strijdende Warschau. Te midden van ruïnes, dood en voortdurende angst ontstaat er een gevoel – broos, onzeker, elke dag op de proef gesteld.
Tijdens de Opstand van Warschau baant de eenheid van kapitein „Stefan" zich door de rioleringen een weg uit de Oude Stad. In het donker, in de benauwdheid en onder levensgevaar kan elke stap de laatste zijn. De commandant weet dat het leven van zijn soldaten en van de vrouw van wie hij houdt afhangt van zijn beslissingen. De opstand is niet alleen een strijd om de stad, maar ook om menselijkheid, hoop en liefde. Wanneer alles uiteenvalt, moeten de personages keuzes maken die hen voorgoed zullen veranderen.
„Mój kapitan" is een ontroerend verhaal over moed, verlies, de kracht om te overleven en over het feit dat zelfs in de donkerste momenten zin in het leven te vinden is.